1941年
4月15日，發(fā)表《黨與抗日民主政權(quán)》一文，闡述中國共產(chǎn)黨關(guān)於建立抗日民主政權(quán)的基本理論和政策。
1942年
9月，任中共中央北方局太行分局書記。
1943年
1月26日，在中共中央太行分局高級干部會議上對五年來對敵斗爭作了系統(tǒng)總結(jié)，概括了軍事、政治、經(jīng)濟、文化等方面對敵斗爭的重要經(jīng)驗，並提出今后對敵斗爭的方針。強調(diào)一切政策、一切工作的出發(fā)點，都必須掌握中日矛盾的實質(zhì)，發(fā)展抗日民族統(tǒng)一戰(zhàn)線。要以堅持敵后斗爭去影響全國，爭取戰(zhàn)后團結(jié)建國。
7月2日，發(fā)表《太行區(qū)的經(jīng)濟建設(shè)》一文。指出發(fā)展生產(chǎn)是打破敵人封鎖、建設(shè)根據(jù)地自給自足經(jīng)濟的基礎(chǔ)，發(fā)展農(nóng)業(yè)和手工業(yè)是生產(chǎn)的重心。
10月6日，中共中央北方局與太行分局合並，任北方局代理書記，主持晉冀魯豫地區(qū)黨政軍工作。
1945年
6月，在中國共產(chǎn)黨第七次全國代表大會上，當(dāng)選為中央委員。
8月，日本宣布投降。此時，與劉伯承領(lǐng)導(dǎo)的抗日根據(jù)地已擴大為太行、太岳、冀魯豫、冀南等四個地區(qū)。中共中央決定成立晉冀魯豫中央局和晉冀魯豫軍區(qū)，任中央局書記和軍區(qū)政治委員。
9月至10月，為反擊國民黨軍向解放區(qū)的進攻，同劉伯承指揮上黨戰(zhàn)役、邯鄲戰(zhàn)役。
1946年
6月，蔣介石大舉進攻中原解放區(qū)，發(fā)動全面內(nèi)戰(zhàn)。
8月至翌年1月，與劉伯承先后組織指揮了隴海、定陶、鄄城、滑縣、鉅（野）金（臺）魚（鄉(xiāng)）等戰(zhàn)役。
1947年
5月，任中共中央中原局書記。
6月30日，同劉伯承率晉冀魯豫野戰(zhàn)軍主力，強渡黃河，發(fā)動魯西南戰(zhàn)役，揭開了人民解放軍全國性戰(zhàn)略進攻的序幕。
8月，同劉伯承率野戰(zhàn)軍主力，千裡躍進大別山地區(qū)。在國民黨軍重兵圍攻中堅持了大別山斗爭，把戰(zhàn)線推進到長江北岸，在中原地區(qū)站穩(wěn)了腳。
1948年
5月9日，任中共中央中原局第一書記、中原軍區(qū)及中原野戰(zhàn)軍政治委員。
5月，與劉伯承發(fā)起宛東戰(zhàn)役。
7月，與劉伯承發(fā)起襄樊戰(zhàn)役。
9月至翌年1月，人民解放軍進行了遼沈、淮海、平津三大戰(zhàn)役，摧毀了蔣介石賴以維持其反動統(tǒng)治的主要軍事力量。
11月16日，中共中央軍委決定由劉伯承、陳毅、鄧小平、粟裕、譚震林組成總前委，鄧小平任書記，指揮淮海戰(zhàn)役。淮海戰(zhàn)役共殲滅國民黨軍55萬人。
1949年
2月5日，中原野戰(zhàn)軍改編為第二野戰(zhàn)軍，任政治委員。
3月，參加中共七屆二中全會，后任中共中央華東局第一書記。
3月31日，為總前委起草《京滬杭戰(zhàn)役實施綱要》。
4月至5月，同劉伯承、陳毅等指揮渡江戰(zhàn)役，解放南京、上海及蘇、皖、浙、贛、閩等省廣大地區(qū)。
9月30日，在中國人民政治協(xié)商會議第一屆全體會議上，當(dāng)選為中央人民政府委員。
10月1日，出席中華人民共和國開國大典。
10月19日，在中央人民政府委員會第三次會議上，被任命為中國人民革命軍事委員會委員。
10月至12月，同劉伯承等率部進軍西南，解放川、康、滇、黔等省。
11月23日，任中共中央西南局第一書記。
12月2日，任西南軍政委員會副主席。
1950年
2月22日，任西南軍區(qū)政治委員。
本年，領(lǐng)導(dǎo)西南地區(qū)的土地改革、剿匪、政權(quán)建設(shè)、恢復(fù)和發(fā)展生產(chǎn)。
（中央文獻研究室鄧小平研究組）
